Вторым местом эвакуации МИМЭССХ стал Арзамас. 77 студентов института, в основном электриков, направились в Арзамас под руководством доцента Ивана Степановича Синяговского, ставшего деканом факультета электрификации вуза. Доценты МИМЭССХ М.Д. Каминский и В.Н. Лымзин работали в Арзамасе преподавателями физики и механики.
Уже в конце октября 1941 г. в Арзамасе был проведён приём студентов на I курс. Постепенно филиал вырос до факультета, имеющего три курса к моменту возвращения в Москву в октябре 1943 г. Лаборатории, кабинеты, часть взятого из Москвы оборудования, приборов, литературы разместили в помещениях местных техникумов. Для усиления качества педагогической работы вуза использовались преподавательские кадры двух техникумов и педагогического института, работавших в Арзамасе. Районный центр Горьковской области был тогда небольшим по численности населённым пунктом – около 30 тысяч населения, но он гостеприимно встречал всех эвакуированных.
Около 100 человек инженерно-технического и производственного состава мастерских МИМЭССХ были оставлены в Москве. В столице продолжали работать и сотрудники, охранявшие жилой фонд и имущество института. Не смогли уехать и отдельные преподаватели, эвакуация которых была затруднена по состоянию здоровья или наличию тяжелобольного члена семьи.
Когда военная угроза для Москвы миновала, встал вопрос о возвращении эвакуированных в столицу. В сентябре 1943 г. правительство Советского Союза приняло решение о реэвакуации многих вузов, в том числе и МИМЭССХ в столицу. Вскоре появилось распоряжение «Собрать институт в Москве, ликвидировать филиал в Арзамасе!» Как результат, в октябре 1943 г. институт был в полном сборе и возобновил свою работу в Москве.
Новый, 1943-1944 учебный год в Москве начался с ноября месяца. Все занятия со студентами проходили без скидки на условия военного времени. Контингент студентов составлял 650 человек. Подготовка инженерных кадров в институте и оказание помощи сельскому хозяйству в освобожденных от оккупации районах и областях продолжалась до полного окончания войны.
В 1944-1945 годах МИМЭССХ приводил в порядок учебно-материальную базу института, уделяя особое внимание восстановлению опытного хозяйства «Степаньково», которое несколько месяцев находилось на оккупированной территории Шаховского района Московской области. Война всегда особый период в жизни и работе любого института. Исключительной была дисциплинированность всего коллектива МИМЭССХ не только в начальный период Великой Отечественной войны, но и на протяжении всех четырех лет испытаний. Ни опозданий, ни прогулов со стороны сотрудников практически не было. Во время тревог, не обращая внимания на вой сирен, преподавателями читались лекции. Многие доценты и профессора вели занятия по родственным дисциплинам, заменяя коллег, ушедших на фронт. Несмотря на то, что учебный процесс продолжался два года в разных концах страны – Москве, Арзамасе и Кзыл-Орде, сотрудники МИМЭССХ продолжали оставаться единым коллективом, отдавая все силы победе над врагом – и в учебных аудиториях, и в производственных мастерских, и на полях.
По материалам Монографии «Тимирязевская академия в годы Великой Отечественной войны».
Авторы: Ректор РГАУ-МСХА им. К.А.Тимирязева, академик РАН, профессор В.И. Трухачев,
Председатель Совета ветеранов РГАУ — МСХА имени К.А. Тимирязева, доктор экономических наук, профессор Ю.И. Агирбов,
Заведующий кафедрой истории РГАУ – МСХА им. К.А.Тимирязева, доктор исторических наук, доцент А.Б. Оришев.