Всю свою педагогическую и научную деятельность известный ученый посвятил КубГАУ, в котором с 1979 года начал трудовой путь ассистентом кафедры тракторов и автомобилей.
В 1987 году защитил диссертацию и получил ученую степень кандидата технических наук.
В 1990 году решением Государственного комитета СССР по народному образованию ученому присвоено ученое звание доцента по кафедре охраны труда. С 1999 года по решению Ученого совета Кубанского государственного аграрного университета является профессором.
С 1 июня 1992 года Сергей Михайлович назначен на должность заместителя декана, с 2007 года — стал и.о. декана, а позже деканом факультета механизации.
За время руководства Сергею Михайловичу удалось укрепить материально-техническую базу факультета, оснастить аудитории и лаборатории самыми современными машинами и оборудованием ведущих зарубежных и отечественных компаний. На сегодня на факультете функционируют 10 учебных центров ведущих мировых производителей и дилеров сельскохозяйственной и автотракторной техники.
Сидоренко С.М. пользовался непререкаемым авторитетом и уважением среди коллег. Студенты и выпускники отзываются о нем как настоящем патриоте Родины и своего университета, умном, талантливом, обаятельном человеке, умеющем зажечь своей идеей и повести за собой.
Своим примером Сергей Михайлович учил опираться на традиции, заложенные учителями, стремиться к развитию для укрепления технологической и продовольственной безопасности России. Учащиеся, сотрудники и выпускники факультета механизации свято чтят Кодекс чести механика, инициатором которого был учёный.
Ректорат, Институт механики и энергетики имени В.П. Горячкина и вся большая тимирязевская семья скорбит в связи с утратой коллеги и выражает глубокие соболезнования родным и близким С.М. Сидоренко.