Слушатели цифровой кафедры разработали ДНК-маркеры для защиты рапса от опасного гриба

Уникальный эксперимент на стыке полевой селекции и биоинформатики стартовал на кафедре молекулярной селекции, клеточных технологий и семеноводства. Студенты магистратуры 2 курса, одновременно проходящие обучение по программе цифровой кафедры «Цифровые технологии в садоводстве и садово-парковом строительстве» завершили первый этап масштабного GWAS-анализа и перешли к валидации маркерных систем.

19 Май / 2026

Молодые исследователи совместно с преподавателями цифровой кафедры отобрали коллекцию генотипов рапса, часть из которых показала полевую устойчивость к фомозу (Phoma lingam), а часть – восприимчивость. Затем с помощью полногеномного поиска ассоциаций (GWAS) они «просканировали» несколько десятков тысяч SNP-маркеров.

Путем обработки терабайта сырых данных секвенирования, а также используя Python-скрипты слушатели цифровой кафедры идентифицировали 14 локусов, достоверно связанных с устойчивостью к грибу.

На данный момент команда тестирует три маркерные системы на расширенной выборке. Разработаны праймеры для HRM-анализа (High Resolution Melting).

Если валидация подтвердит эффективность маркеров (ожидаемая точность прогноза – 92-95%), они будут переданы в селекционно-семеноводческий центр рапса для ускоренного создания линий рапса, устойчивых к фомозу, без использования химических фунгицидов.

Текст, медиа: Миронов А.А.